Bei einer Morton-Neurom-Operation kann die Narkoseart individuell angepasst werden. Häufig wird eine Lokalanästhesie eingesetzt, bei der nur der betroffene Fuß betäubt wird, was eine schnelle Erholungszeit ermöglicht. Alternativ kann eine Regionalanästhesie, wie eine Spinal- oder Leitungsanästhesie, gewählt werden, bei der das gesamte Bein betäubt wird, während der Patient wach bleibt. In einigen Fällen, insbesondere bei längeren oder komplexeren Eingriffen, wird eine Vollnarkose bevorzugt, bei der der Patient während der Operation schläft.